Criado em 2017 para ser um influente centro de produção e difusão do conhecimento científico e de conexão da ciência com a sociedade. Ele possui três frentes de atividades: um Centro Internacional de Pesquisa, uma Escola de Talentos e um Domo Digital, estrutura imersiva 360 graus que pode funcionar como um Planetário.
A mantenedora do Instituto Principia é a Fundação Instituto de Física Teórica, criada em 1951, como entidade de direito privado sem fins lucrativos. Desde 1952 ela ocupa sua a sede à Rua Pamplona 145. A entidade dispõe de plena autonomia administrativa, financeira, científica e patrimonial e cede seu espaço para a atuação do Instituto Principia.
A Fundação foi criada pelo engenheiro Hugo Leal Ferreira, e outras personalidades importantes da época, o qual tornou-se o seu primeiro presidente. O primeiro diretor científico foi o Prof. Dr. Carl Friedrich Von Weizsäcker, físico de renome internacional, e membro do Instituto de Física Max Planck de Göttingen, Alemanha.
Na década de 1970 a Fundação abriu cursos de mestrado e doutorado de grande renome nacional. Atualmente sua função é apoiar o Instituto Principia por ela criado.
